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【解説】最近よく聞く「PCR法」って何?基礎の基礎から、その凄さまで解説
- 1 :スナフキン ★:2020/04/22(水) 09:21:40 ID:iA1K4vmc9.net
- 新型コロナウイルスCOVID-19による感染症の世界的流行で、感染の有無を調べる方法としてPCR法という検査方法を耳にするようになりました。
このPCR検査、どういう検査法だかご存知ですか?
なんでも、口や鼻にある粘膜からとった検体を使って、ウイルスのDNAにある遺伝子の一部を大量に複製させることで、とても小さいウイルスの存在をはっきりさせる、ということですが、遺伝子の複製ってどうやってやるのでしょう?
DNAや遺伝子の検査や研究は、ウイルス検査以外にも、分子生物学の分野で広く行われています。ここでは、法医学の分野で、長い間DNAを鑑定してきた山形大学医学部の梅津和夫氏の本『DNA鑑定』から、PCR法のしくみを見てみましょう。
そもそもDNAとか遺伝子ってどう違うの?
まず、何かと混同されがちな「DNA」「遺伝子」「染色体」「ゲノム」といった用語を整理しておこう。
頬の内側や歯茎などを採取用の棒でこすって、集めた細胞を、染色用の液(塩基性染色液)で浸してから顕微鏡で覗いてみよう。すると、細胞の中に必ず1個ある核の中、何かが染色液に染まっているのがわかる。これがDNAである。
DNAは通常、細い糸のようになって「ヒストン」というタンパク質に巻きついている。これをクロマチン構造という。
クロマチン構造が棒状になったかたまりが「染色体」である。染色体は通常の細胞では見ることができず、細胞分裂(組織の細胞が分裂する体細胞分裂や、生殖細胞が分裂する減数分裂)のときのみ出現し、このときは染色液によく染まるのでこの名がある。
さらに、細い糸状のDNAには、ところどころに「遺伝子」がある。親から子へと受け継がれるさまざまな形質は、DNA内でタンパク質をコードしている遺伝子に書き込まれた設計図をもとにしてつくられている。この設計図、すなわち遺伝情報は、遺伝子の中でシトシン(C)、グアニン(G)、チミン(T)、アデニン(A)の4種類の塩基がどう並んでいるか(塩基配列)によって規定されている。
そして、生物のDNAが持っている遺伝情報のことを「ゲノム」という。いわば、DNAが形のある「形質」なら、ゲノムとは形のない「情報」の総体なのである。
知っているつもり(!?)のDNAと染色体、遺伝子、ゲノム
DNA 細胞にある糸状のものが巻きついた形をしたもの。遺伝子を含む
染色体 DNAが巻きついている「クロマチン構造」が棒状に集まったもの。細胞分裂時に現れる
遺伝子 DNA中にある遺伝情報が書き込まれた、生命の設計図の部分
ゲノム 設計図に書き込まれている遺伝情報
【図】DNA、染色体、遺伝子の関係と4つの塩基からなるDNAの構造
DNA、染色体、遺伝子の関係と、4つの塩基からなるDNAの構造(『DNA鑑定』の図をもとに作成)
https://i.imgur.com/CVR9Im3.png
このように、細胞の核の中にはたくさんのDNAが詰まっている。
なお、「DNA」とは、生命の設計図であるデオキシリボ核酸(deoxyribonucleic acid)の略語である。その基本構造は、地球上に存在するすべての生物に共通である。
続きはソースで
https://gendai.ismedia.jp/articles/-/71884
- 2 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:22:49 ID:RSjqTWOc0.net
- 武田邦彦「PCRは新型以外のコロナも陽性になる」
- 3 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:23:13 ID:vxic5zLp0.net
- GACTってここから取ってるのか?
- 4 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:23:47 ID:dG7pgP5Y0.net
- >>1
こんなに長く書いたあと「続きはソースで」って
最初からまとめろや
- 5 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:24:20 ID:dTNvh1Pu0.net
- >>1
寒流検査がインチキってのは分かった
- 6 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:24:24 ID:bKFRMJ+/0.net
- RNAって何?
- 7 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:25:28 ID:ONVh63ND0.net
- >>2
完全に武田はオカルト自称専門家になり下がったな
- 8 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:26:47 ID:CHdogsn30.net
- >>6
リボヌクレオチド酸
- 9 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:26:50 ID:kS+zX5l30.net
- 続きの方にしかPCRのことが書いてない
- 10 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:28:21 ID:vEI67WaV0.net
- PCRのフルネーム言えない低学歴ばっか
- 11 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:28:55 ID:Wo+LaSl50.net
- PCRはポリメラーゼ チェイン リアクションの略
ウイルスの遺伝子の両端にくっつくプラマーってやつを使って何倍にもその部分だけ増やす
要するにウイルスが組み込まれてないと何も出来ない
- 12 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:29:12 ID:XowcXO+F0.net
- >>6
DNAは構成がAGCT で2重らせん
RNAは構成がAGCU で1重らせんと2重らせんがある
- 13 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:30:09 ID:fo/BAsZK0.net
- >>11
プライマーな
- 14 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:32:08 ID:Wo+LaSl50.net
- >>13
打ち間違えたorz
- 15 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:33:35 ID:8sxcJoug0.net
- 1分で2つに分裂するウイルスがある
シャーレにひとつ容れておくと一時間で
シャーレがいっぱいになる
では最初からふたつ容れておくと
シャーレがいっぱいになるのは
何分後?
- 16 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:33:50 ID:eY/lRmwX0.net
- 玉川「そうだったんだ!知らなかったよ!」
- 17 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:36:41 ID:nBjrsdI30.net
- 使えない検査薬大杉
- 18 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:37:34 ID:RSjqTWOc0.net
- >>15
47都道府県がトーナメントで対戦するときの準決勝までの試合数
- 19 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:40:03 ID:QnBzGFMD0.net
- プライベート
コロナ
りんりんらんらんそーせーじ
- 20 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:41:04 ID:+wGa9jSO0.net
- 献体って
死んじゃダメだろ
- 21 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:41:19 ID:pgmeG2tZ0.net
- とりあえずWikipediaでも見て桶。たいていの事は書いてあるぞ。
https://ja.wikipedia.org/wiki/ポリメラーゼ連鎖反応
- 22 :2chのエロい人 がんばれ!くまモン!:2020/04/22(水) 09:49:30 ID:e/RAgKZv0.net
- >>3
高校の時、生物履修してなかったから、
わかるのにちょっと時間がかかってしまった。
- 23 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:50:21 ID:9AUb7ffz0.net
- >>1
うん全く読む気がしなくて分からんけど
- 24 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:50:53 ID:FrbOpj6d0.net
- 自分嘔吐反射が強くてインフルの検査が辛いんだけど
この検査はもっと辛いですか?
- 25 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:54:05 ID:B3bpCY4j0.net
- >>2
プライマーのデザイン間違えるとそうなるな
- 26 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:55:19 ID:r3fqGLHX0.net
- >>14
プラマーといえばプラマーヴィンソン症候群
- 27 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 09:55:48 ID:HdAall+W0.net
- PCR検査は複製して増やすから時間かかるのはなんとなく分かった
では抗体検査はなんですぐ終わるの?
- 28 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:02:23 ID:0XcbuWyM0.net
- >>15
59
- 29 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:03:30 ID:m3adUcIU0.net
- エスティーティーアール
- 30 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:03:40 ID:2EAZTkJ20.net
- >>24
うん
- 31 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:12:14.25 ID:CVczk+Q90.net
- 靴下4回切るだけの超簡単マスク「目から鱗」「これが優勝」「断トツ簡単」「頭いい」「ブラの次は靴下」
http://bzq.senaputra.com/sz?ktjid8m2c9/yczlnivw73ut.html
トイレットペーパー品薄が解消されつつある今、買い占め品を持て余し返品を求める人がいる?店側が返品を断る事例が国内外で発生
http://bzq.senaputra.com/vb?2fd4ct6gr/5f42zvvj44x3.html
- 32 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:14:44 ID:UmClsMUt0.net
- >>1
こんなことも知らんでお前ら「PCR、PCR」騒いでたのか?
- 33 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:22:54 ID:+G5MA2O50.net
- なんちゃら酸だからリトマス試験紙が赤くなったら陽性ってことを難しくして医療が暴利むさぼってるだけ
コロナ気になるやつはリトマス試験紙でも舐めて自己診断しなさいってこった
- 34 :!ninja:2020/04/22(水) 10:26:44 ID:rLD8RVbM0.net
- 壁の話ではないのか
- 35 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:28:05 ID:naUEirIo0.net
- こんなの生物系学部いたやつは散々やったろ
- 36 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:28:06 ID:gJuJnswC0.net
- 新型コロナはDNA持ってないからPCR検査出来るようになるまでの前処理に
滅茶苦茶手間と時間かかって難易度も高いと聞いた
- 37 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:34:16 ID:W+eiKXFH0.net
- 二月上旬のニュースだろこれ
- 38 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:36:03 ID:agC/zLPF0.net
- まず、RNAをDNAに転写する酵素を使ってDNAを作る。
そうしてそれをPCRにかけるのだが、
RNA鎖単独でも感染性は皆無ではないから、
それを含む飛沫を吸い込んだなら立派に感染するリスクがある。
だからそれなりの施設で作業しないと危ないかもしれない。
- 39 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:39:03 ID:pgmeG2tZ0.net
- >>27
抗体は体内で大量につくられる。
抗体は特定の対象(ウィルスに感染して表面に出てきた糖鎖)にくっつく性質がある。
くっついたら色が変わる検査キットが作れたら、検体塗って反応するまで数分待つだけ。
- 40 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:44:39 ID:xGFV4bNu0.net
- 火星とかで微生物が見つかったら、そのゲノムはやはりATCGなんだろうか。
例えば深海とかすごく過酷な環境に住む生物の遺伝子はATCGなんだろうか。
それ以外の生物は今のところ見つかってないね。
僕は地球内で自然発生したと考えてる。
たまたま自己複製の性質が産まれたんだろうな。
でも、方法はこの四進数以外にも無限にあるだろうな。
- 41 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 10:46:55 ID:pgmeG2tZ0.net
- >>36
前処理だけじゃなく、後処理もあるよ。
PCR法自体は素晴らしいものだけど、所詮は実験室レベルの道具。
(前処理)
カプシド分解してRNA抽出(高校あたりでDNA抽出の実験やった事あるはず)
RNA→DNAの逆転写。
プライマー混ぜてターゲット断片作成。
断片を分離。
(PCR)
PCR法にて増幅
(後処理)
電気泳動法などで、増幅した断片を大きさ別に分離(バーコードみたいなやつ)
目視で、断片の移動距離から、陽性・陰性を判定する。
なお、電気泳動で移動する距離は時間によって変わるので、基準となる線も
用意しておかなければならない。
こんな感じかね。
- 42 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 11:00:31.28 ID:wBj+lwWf0.net
- >>36
RNAはDNAと違って扱い難しいからな
とにかく分解しやすい
といって手袋もマスクもせずにすんなりできるトンデモもいるって話もあるが
- 43 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 11:04:35 ID:SpmPtQDz0.net
- 中韓からやたらに届く検査キットで、素人がお手軽に検査できるというのが信用できないんだが。
- 44 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 11:05:40 ID:uagVSwM40.net
- >>42
今のRNA抽出キットをちゃんと使うと、RNAも普通に-30˚Cで保存できるし、2-3回なら凍結再融解も問題ない
さすがに手袋は他とのコンタミ防止で必要だけど、完全にキモはRNaseの排除でちゃんとできるとDNAと同じように扱える
- 45 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 11:09:36 ID:8PBTIRqU0.net
- なるほど
わからん
- 46 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 11:09:55 ID:wBj+lwWf0.net
- >>44
随分進んでるなあ
10年前くらいまでは手袋マスクのキャップと完全防備でも泳動した時にはバンドがないとかよく聞いたw
- 47 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 11:13:48 ID:NCbrou+g0.net
- サプリメントにDNAとか核酸とかあるんだけど、あれって何?
- 48 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 11:14:23 ID:jnpbHwpn0.net
- 陽性でも根本治療はできないので自宅療養
陰性でも100%ではないので改善するまで自宅療養
- 49 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 11:16:29 ID:xaNvGd3K0.net
- 開始コドンとかよーわからん事書いてあったけどどうやらPCなんかと同じなんだなと思った
- 50 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 11:18:50 ID:ng2GfUQN0.net
- >>41
リアルタイムPCRだと後処理部分はいらないだろ
- 51 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 11:24:52 ID:/RQyuyId0.net
- m9(^Д^) pgr
- 52 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 12:06:36 ID:RPx0sLS80.net
- >>47
無知な人を対象にしたインチキ商法だろう
- 53 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 12:07:03 ID:58y5wQIq0.net
- >>1
pcリサイクル法の略です。
- 54 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 12:09:59 ID:Xzfkv17F0.net
- >>41
おじいちゃん、リアルタイムPCRが出てから何十年も経つよ
- 55 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 12:17:39 ID:H3UheZYj0.net
- >>6
DNAは原本、RNAはそのコピー。生物はコピーを
元にタンパク質を作るが、このウイルス(生物では無い)
はコピーからコピーを作る特殊能力があって、コピーを
人間の細胞に作らせて、と同時にウイルスのタンパク質
も作らせて、最後人間の細胞を破壊してウイルスを
周りに撒き散らす。
- 56 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 12:20:20 ID:XowcXO+F0.net
- 40年くらい前に頭の体操で初めてその問題を見た
- 57 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 12:20:46 ID:XowcXO+F0.net
- 安価忘れたw
>>15
- 58 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 12:38:33 ID:0pnAPKaX0.net
- STAPのときにもさんざんやってたのに
- 59 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 12:39:09 ID:926o4mmU0.net
- なる程わからん
- 60 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 12:52:47 ID:iRz755Ft0.net
- ポリメレース チェイン リアクション
と発音すると知的に見えるからオススメ
>>11だと一般人ぽい
- 61 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 12:57:30 ID:6bwkt0EX0.net
- PCR250R
- 62 :名無しさん@1周年:2020/04/22(水) 13:41:32 ID:S9p677xL0.net
- 完全に理解した(歯ぎしり)。
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